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生物学论文_南宁地区酸柠檬细菌多样性及潜在功
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摘要:文章目录 1 材料与方法 1.1 材料与试剂 1.1.1 样品 1.1.2 主要试剂 1.2 仪器与设备 1.3 实验方法 1.3.1 酸柠檬样品中微生物宏基因组DNA提取 1.3.2 细菌16S r RNA的PCR扩增 1.3.3 高通量测序及生物信
文章目录
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
1.1.1 样品
1.1.2 主要试剂
1.2 仪器与设备
1.3 实验方法
1.3.1 酸柠檬样品中微生物宏基因组DNA提取
1.3.2 细菌16S r RNA的PCR扩增
1.3.3 高通量测序及生物信息学分析
1.3.4 PICRUSt功能预测
1.3.5 多元统计学分析
2 结果与分析
2.1 酸柠檬细菌序列丰度和多样性分析
2.2 基于微生物分类学地位酸柠檬样品细菌菌群多样性分析
2.3 OTU统计分析
2.4 PICRUSt功能预测
3结论
文章摘要:为解析广西南宁市家庭自制酸柠檬中的细菌群落结构及潜在功能,该研究采用Illumina Mi Seq高通量测序技术对酸柠檬样品细菌群落多样性进行分析,并采用PICRUSt软件对其基因功能和表型进行预测。结果表明,酸柠檬中微生物多样性较高,不同样品间优势细菌含量差异较小。优势细菌门为变形菌门(Proteobacteria)、硬壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),累计平均相对含量达98.23%;优势细菌属为劳尔氏菌属(Ralstonia)、伯克霍尔德菌属(Burkholderia)、诺卡氏菌属(Nocardia)、假单胞菌属(Pelomonas)和别样杆菌属(Alistipes),平均相对含量分别为66.13%、8.18%、2.87%、1.27%、1.01%。酸柠檬中具有氨基酸转运与代谢、能量生产和转换功能的细菌序列占总序列的比例较高,均>7%,可促进酸柠檬独特风味的形成。
文章关键词:
论文分类号:TS255.4;TS201.3
文章来源:《西安文理学院学报(社会科学版)》 网址: http://www.xawlxyxb.cn/qikandaodu/2021/1207/707.html